Sledenje različicam SARS-CoV-2

Od 1. januarja 2021 do 16. marca 2021 smo v NLZOH skupaj s KISLD s sekvenciranjem celotnih genomov analizirali 2908 vzorcev. Skupaj z IMI smo zaznali 46 različic virusa SARS-CoV-2.

V Slovenije še vedno pomembno prevladuje različica B.1.258.17 z 77,92 % v celotni strukturi rezultatov (prejšnji teden 81,03 % oz. 81,9 % dva tedna nazaj). Na drugo mesto se je povzpela različica, ki zbuja največ pozornosti, to je angleška različica B.1.1.7.  V tem tednu beležimo 7,6 odstotni delež in je bila še prejšnji teden s 3,78 % na četrtem mestu med vsemi različicami. Sledita B.1. 258 s 4,75 % in B.1.1.70 s 3,27 % analiziranih vzorcev.

Število primerov angleške različice, ki smo jih potrdili bodisi s sekvenciranjem celotnega genoma bodisi s presejalnim sekvenciranjem t.i. S gena, se je povzpelo na 511. Tako se je število različice B.1.1.7 od prejšnjega tedna ponovno podvojilo (do prejšnjega tedna smo zabeležili 238 primerov). Od tega smo jih skupaj s KISLD potrdili 221 primerov, 290 pa jih je potrdil IMI. 
Pozorno spremljamo tudi t.i. južnoafriško različico z oznako B.1.351 – tudi tu se je število od prejšnjega tedna podvojilo – z 10 na 21 potrjenih primerov. 19 primerov je potrdil IMI, kar pomeni, da pripadajo pretežno osrednji slovenski regiji.
Do danes smo potrdili skupaj 20 primerov različice B.1.525 oz. nigerijske različice. Različica A.27, ki tudi nosi eno od kritičnih mutacij, se je povzpela z 12 na 14. Pozitivna informacija je tudi, da se število brazilske različice P.1 v zadnjem tednu ni povečalo in ostajamo pri enem potrjenem primeru.