V NLZOH dajemo velik poudarek na kakovost naših storitev, predvsem v smeri zagotavljanja točnih in verodostojnih rezultatov. Kot akreditiran laboratorij po SIST EN ISO/IEC 17025 sodelujemo v različnih primerjalnih testih. S strani pristojnih ministerstev smo za več področij izvajanja kemijskih analiz živil in krme imenovani za Nacionalni referenčni laboratorij (NRL).
V okviru obveznega sodelovanja NRL z Evropskimi referenčnimi laboratoriji (EURL) sodelujemo v primerjalnih testih, ki so običajno še posebej zahtevni. Za rezultate testiranj imamo zastavljene zelo visoke kriterije in cilje, ki jih v veliki meri tudi dosegamo. V primerjalnem testu iz področja testiranja kovin in dušikovih spojin v živilih in krmi smo v letu 2024 glede na dosežene rezultate našega laboratorija bili uvrščeni med tri najboljše evropske laboratorije na področju analiz kovin v živilih, za kar smo prejeli s strani EURL priznanje, certifikat »of excellent performance«. To priznanje je za nas in naše delo zelo pomemben dosežek in potrditev kakovosti izvajanja storitev.
Vlada Republike Slovenije je na 19. redni seji, dne 25. 7. 2013, sprejela Sklep o ustanovitvi Nacionalnega laboratorija za zdravje, okolje in hrano (NLZOH). Skladno s sklepom Vlade so z dnevom pričetka delovanja NLZOH prenehali območni zavodi za zdravstveno varstvo.