V Nacionalnem laboratoriju za zdravje, okolje in hrano (NLZOH) smo v sodelovanju s KISLD UKC Ljubljana od 1. 1. 2021 do 18. 2. 2024 s sekvenciranjem zaporedij celotnih genomov analizirali 48.029 vzorcev. Od tega je bilo 26.204 genomov sekvenciranih v sodelovanju s Kliničnim inštitutom za specialno laboratorijsko diagnostiko na Pediatrični kliniki Univerzitetnega kliničnega centra Ljubljana in 8.509 genomov v sodelovanju z ECDC.
Tabela 1 prikazuje število analiziranih genomov virusa SARS-CoV-2 od 2020 do 2024 in po tednih sprejema vzorcev v laboratorij za tekoče leto.
V zadnjem obdobju, od 12. 2. 2024 do 18. 2. 2024, smo uspešno sekvencirali genomska zaporedja 20 SARS-CoV-2 PCR-pozitivnih vzorcev, vsi iz sheme A. V vseh vzorcih je bila prisotna ena od podrazličic omikrona.
V spodnji tabeli so predstavljene različice virusa SARS-CoV-2, potrjene v zadnji seriji sekvenciranja.
ECDC od 23. 3. 2023 nobene različice ne uvršča med VOC (»Variants of Concern«), medtem ko se podrobneje spremlja linije in hčerinske linije XBB.1.5-like in XBB.1.5-like+F456L (VOI, »Variants of Interest«) in BA.2.86 (VUM, »Variant Under Monitoring« (https://www.ecdc.europa.eu/en/covid-19/variants-concern).
V tabeli 3 je prikazano število potrjenih primerov posameznih različic, ki jih podrobneje spremljamo.
Poročilo NLZOH in KISLD UKC Ljubljana za teden od 12. 2. 2024 do 18. 2. 2024
Poročilo IMI 7. 1. 2024 do 28. 1. 2024
V sodelovanju z GISAID smo pripravili animacijo, ki je dostopna na tej povezavi in omogoča različne možnosti pregledovanja razširjenosti različic virusa v Sloveniji. Več
Nacionalna strategija sledenja znanim in novim različicam
Sledenje različicam SARS-CoV-2 v Sloveniji izvajamo v Nacionalnem laboratoriju za zdravje, okolje in hrano (NLZOH) v sodelovanju s Kliničnim inštitutom za specialno laboratorijsko diagnostiko (KISLD) Pediatrične klinike Univerzitetnega kliničnega centra Ljubljana ter na Inštitutu za mikrobiologijo in imunologijo (IMI) Medicinske fakultete v Ljubljani.
Vlada Republike Slovenije je na 19. redni seji, dne 25. 7. 2013, sprejela Sklep o ustanovitvi Nacionalnega laboratorija za zdravje, okolje in hrano (NLZOH). Skladno s sklepom Vlade so z dnevom pričetka delovanja NLZOH prenehali območni zavodi za zdravstveno varstvo.