Generic selectors
Exact matches only
Search in title
Search in content
objave
javne-objave
Lupa

Sledenje različicam SARS-CoV-2

Od 1. 1. 2021 do 6 . 7. 2021 smo v NLZOH v sodelovanju z KISLD UKC Ljubljana s sekvenciranjem zaporedij celotnih genomov analizirali 9262 vzorcev, od tega je bilo 1667 genomov sekvenciranih v sodelovanju z ECDC. Dodatno so na KISLD sekvencirali še 496 vzorcev, skupno torej 9758 od tega 9566 iz leta 2021.

Pregled števila analiziranih vzorcev po tednih v letu 2021:

Deležna zastopanost različic

Različice in njihovo skupno število je prikazano v spodnjih tabelah. 

Leva tabela izpostavlja le najbolj spremljane različice. Skupno število različic v desni tabeli vključuje le podatke NLZOH.

Število novo potrjenih alfa različic (B.1.1.7 oz. prej imenovana angleška različica) v zadnjem testiranem obdobju je 204 (122 NLZOH + 82 IMI).

Delta različica (B.1.617.2 ) je bila v tem tednu potrjena v skupno 70 vzorcih (11 NLZOH, 59 IMI). IMI je v zadnjem tednu potrdil tudi genetsko različico delta+ v 2 vzorcih.

V 2 primerih smo potrdili tudi jota različico (1 NLZOH + 1 IMI), ter 1 različico kapa (1 NLZOH). Različice gama in beta v obdobju 21. 6. – 27. 6. nismo potrdili.

Skupaj je do zdaj torej potrjenih 134 primerov delta različice, 29 primerov beta različice, 7 primerov gama različice. Različico eta smo do sedaj skupno potrdili v 48 primerih, jota različico v 6 primerih in različico B.1.1.318 v 19 primerih.

Različice v obdobju od 21. do 27. junija

V zadnjem obdobju, od 21. 6. do 27. 6. 2021, smo uspešno posekvencirali 146 vzorcev; 99 iz sheme vzorčenja vseh PCR pozitivnih vzorcev (Shema A; zaradi zmanjšanja števila pozitivnih vzorcev smo od 21. 6. 2021 naprej v sekvenciranje začeli vključevati vse PCR pozitivne vzorce, ki imajo Ct vrednost manj kot 30; pred to spremembo je shema A predstavljala 10% pozitivnih vzorcev) in 47 vzorcev po naročilu epidemiologov (Shema C).

Med 99 vzorci iz sheme A smo dokazali pet različici virusa SARS-CoV-2, alfa (B.1.1.7; n=87, 87,9 %), delta (B.1.617.2; n=9; 9,1 %), kapa (B.1.617.1; n=1, 1,0 %), jota (B.1.526; n=1, 1,0 %) ter C.36.3 (n=1, 1,0 %).

Poročilo NLZOH in KISLD UKC Ljubljana za teden 21. 6. do 27. 6. 2021

Poročilo IMI za teden 21. 6. 2021 in 27. 6. 2021

V sodelovanju z GISAID smo pripravili animacijo, ki je dostopna na tej povezavi in omogoča različne možnosti pregledovanja razširjenosti različic virusa v Sloveniji. Več

Nacionalna strategija sledenja znanim in novim različicam
Sledenje različicam SARS-CoV-2 v Sloveniji izvajamo v Nacionalnem laboratoriju za zdravje, okolje in hrano (NLZOH) v sodelovanju s Kliničnim inštitutom za specialno laboratorijsko diagnostiko (KISLD) Pediatrične klinike Univerzitetnega kliničnega centra Ljubljana ter na Inštitutu za mikrobiologijo in imunologijo (IMI) Medicinske fakultete v Ljubljani.

Storitve
Kakovost
Iskanje
O nas
Lokacije
Skip to content