Konsolidacija in integracija sekvenciranja celotnega genoma v rutinski monitoring v Sloveniji (angleško: Consolidation and Integration of Whole Genome Sequencing (WGS) into Routine Surveillance in Slovenia)

Področje: Mikrobiologija

Kratek naziv: SLOSEQ

Dolg naziv: Konsolidacija in integracija sekvenciranja celotnega genoma v rutinski monitoring v Sloveniji

Identifikacijska številka projekta / Project identification number: 101112671

Opis projekta za širšo javnost / Project description for general community:

Mikroorganizme, ki povzročajo bolezni, lahko zaznamo na tri različne načine: lahko jih gojimo v laboratoriju, jih zaznamo s pripravljenimi protitelesi (kot recimo pri HAT testih) ali uporabimo molekularne metode in iščemo njihov dedni material. Projekt SLOSEQ se bo ukvarjal z molekularnimi metodami in sicer s sekvenciranjem genomov virusov in bakterij. Protokoli in oprema, ki so bili posodobljeni med epidemijo covida, se bodo v projektu še naprej uporabljali za spremljanje tega virusa. Predvsem pa bomo uporabo opreme razširili na spremljanje naslednje pomembne grožnje – večkratno odpornih bakterij (VOB). V projektu načrtujemo razvoj in optimizacijo procesov, s katerimi bomo avtomatizirali in poenostavili trenutno zapletene procese od zaznavanja bakterij ali virusov preko njihovih molekularnih karakterizacij, analiz, do sporočanja med inštitucijami in končne analize, pomembne za spremljanje stanja na nacionalni ravni in širše v Evropi.

Microorganisms that cause diseases can be detected in three different ways: they can be grown in the laboratory, they can be detected with prepared antibodies (as, for example, with HAT tests), or we can use molecular methods and look for their genetic material. The SLOSEQ project will deal with molecular methods, namely the sequencing of the genomes of viruses and bacteria. The protocols and equipment that were upgraded during the covid epidemic will continue to be used in this project to monitor covid virus. More importantly, we will engage the equipment usage broader to monitor the next major threat – multi-resistant bacteria (also known as AntiMicrobiobial Resistance; AMR). In the project, we plan to develop and optimize processes to automate and simplify complex processes from a bacterium or virus detection through pathogen characterization at the molecular level, analysis to data sharing and communication between institutions, and final analysis important for monitoring the situation nationally and more broadly in Europe.

Opis projekta za znanstveno in strokovno skupnost / Project description for scientific and professional community:

S tem projektom nameravamo vzpostaviti, optimizirati in potrditi delovne postopke, protokole ter analitične/vizualne platforme, ki bodo olajšali izvajanje WGS v nacionalnem nadzoru, v okoljih občasnih izbruhov in izbruhov bolezni.

Vzpostavljena infrastruktura RT-PCR in WGS ter orodja, ki se uporabljajo za zbiranje podatkov o nadzoru SARSCoV-2, bodo nadgrajena in se bodo na nacionalni ravni in ravni EU uporabljali tudi za vzpostavitev genomskega nadzora za dodatne patogene. Poleg tega bomo razvili uporabniku prijazno, odprto dostopno poenostavljeno programsko opremo za analizo in obdelavo podatkov sekvenciranja genomov in nadgradili obstoječe linije in orodja za genomski nadzor, ki se uporabljajo za zbiranje podatkov za nadzor SARS-CoV-2. Zagotovili bomo trajnostni načrt za nadaljnje izvajanje in širšo uporabo razvitega sistema. 

Razviti system in orodja bodo omogočali boljšo pripravljenost in odziv na grožnje javnemu zdravju, trajnost mikrobiološkega sistema javnega zdravja, prispevali k razvoju v e-zdravstveni sistem ter ohranili in okrepili zmogljivosti genomskega nadzora in odzivanja na epidemije v Sloveniji ter izmenjavo podatkov med različnimi javnimi področji.

In this project, we plan to establish, optimize, and validate workflows, protocols, and analytical/visualisation platforms that will facilitate the implementation of WGS in national surveillance in sporadic and outbreak settings.

The established RT-PCR and WGS infrastructure and tools for collecting SARSCoV-2 surveillance data will be upgraded. They will also be used to set up genomic surveillance for additional pathogens at the national and EU levels. In addition, we will develop a user-friendly open-access simplified software to analyse and process genome sequencing data and upgrade the existing genomic surveillance data pipelines and tools used for collecting SARS-CoV-2 surveillance data. We will ensure the sustainability plan for the continued implementation and broader use of the developed system. 

As a result, we will ensure better preparedness and response to public health threats, sustainability of the public health microbiology system, contribute to developing an e-based health system and maintain and strengthen genomic surveillance and epidemic response capacities in Slovenia and data sharing across various public domains.

Družbeni pomen projekta / Social relevance of the project:

V skladu s splošnimi cilji razpisa, ki predvideva integracijo vključevanja metod, ki temeljijo na genomiki v rutinsko spremljanje bolezni in pripravljenost ter odzivanje na čezmejne izbruhe bolezni, si bomo prizadevali za razvoj shranjevanja podatkovnih zbirk, množičnih analiz, avtomatizacije standardnega postopka analize podatkov in samodejnega poročanja primerov. S tem bomo izboljšali spremljanje morebitnih epidemiološko kritičnih razmer v realnem času, in zagotovili zaščito najbolj prizadetega prebivalstva pred okužbami in hudimi zdravstvenimi posledicami.

Digitalna preobrazba zdravstvenega sektorja je ena od najpomembnejših prednostnih nalog v Sloveniji. V okviru tega projekta se bo delovalo v smeri e-poročanja, opredelitve primerov s sprejetjem mednarodnega kodnega sistema in pravočasnega obveščanja mednarodnih organov za skupen odziv in pripravljenost na boj proti grožnjam nalezljivih bolezni za javno zdravje.

In concordance with the general objectives of this call to facilitate the integration of genomics-based methods into routine disease surveillance and cross-border outbreak preparedness and response, we will aim to develop database storage, mass analysis, automatization of the standard data analysis process, and automatic case-based reporting. This will enhance the real-time monitoring of epidemiologically critical situations to protect the most affected population from infections and severe health consequences.

The digital transformation of the health sector is one of the highest priorities in Slovenia. Within the framework of this project, work towards e-based reporting, case definition identification with adopting an international code system, and timely information will be provided to the international bodies for joint response and preparedness to combat the threats of communicable diseases to public health.

Rezultati in izidi projekta / Project results and outcomes:

🧬 Začetek projekta SLOSEQ:

Projekt SLOSEQ – »Konsolidacija in integracija sekvenciranja celotnega genoma v rutinski monitoring v Sloveniji«, ki je sofinanciran s strani EU pod pogodbo 101112671, se je uradno začel s srečanjem partnerjev NLZOH, NIJZ in UL-IMI. Na uvodnem sestanku so bile jasno določene vloge, časovni okvirji in cilji posameznih delovnih sklopov. Dogovorili smo se o skupni viziji in ključnih mejnikih, ki bodo omogočili učinkovito vzpostavitev sistema za nadzor nalezljivih bolezni v Sloveniji na podlagi sistema analiz celotnih genomov.

---

📈 Opredelitev kazalnikov spremljanja v projektu SLOSEQ

Datum: 20. oktober 2023

Avtorici: Tjaša Cerar Kišek in Marjana Strmčnik

V okviru projekta SLOSEQ smo partnerji uskladili ključne kazalnike uspešnosti (KPI) za vse delovne sklope. Kazalniki vključujejo tehnične, organizacijske in komunikacijske cilje – od števila sekvenciranih vzorcev do razvoja programske opreme in napredka pri diseminaciji.

Dogovorjeni kazalniki bodo omogočali redno spremljanje napredka, evalvacijo rezultatov in učinkovito vodenje projekta SLOSEQ.

---

🧫 Sekvenciranje celotnih genomov bakterij: Standardiziran pristop

Datum: 22. december 2023
Avtorica: Sandra Janežič

Na NLZOH smo pripravili enotna delovna navodila za sekvenciranje in analizo bakterijskih genomov, za potrebe epidemiološkega nadzora. Delovno navodilo vključuje vse pomembne korake: od zbiranja in priprave bakterijskih izolatov, do sekvenciranja in analize njihovega dednega zapisa (genoma) in poročanja rezultatov. Z analizo genoma lahko natančno določimo, za katero bakterijo gre, zakaj je odporna proti antibiotikom in kako je povezana z drugimi izolati. Poseben poudarek je namenjen nadzoru kakovosti sekvenčnih podatkov. Vzpostavljena je bila tudi centralna baza bakterijskih izolatov, ki omogoča učinkovito spremljanje genetskih značilnosti pomembnih patogenov.

---

🔁 Medlaboratorijska validacija standardiziranega protokola in začetek pilotnega projekta

Datum: 28. februar 2024
Avtorici: Sandra Janežič in Tjaša Cerar Kišek

S primerjalnim poskusom smo potrdili usklajeno delovno navodilo za sekvenciranje in analizo bakterijskih genomov. Protokol, ki smo ga uvedli na dveh oddelkih znotraj NLZOH – na Oddelku za mikrobiološke raziskave (OMR) v Mariboru in na Oddelku za javnozdravstveno mikrobiologijo (OJM) v Ljubljani – zagotavlja enoten potek dela, od priprave vzorcev in sekvenciranja do poročanja primerljivih rezultatov.

Pilotni projekt: Da bi prikazali uporabnost naše standardizirane metode za rutinsko spremljanje bakterij, smo začeli pilotni projekt, v okviru katerega sekvenciramo genome vseh bakterij, ki proizvajajo karbapenemaze – encime, zaradi katerih so odporne proti antibiotikom iz skupine karbapenemov. Ti antibiotiki so izjemno pomembni, saj pogosto predstavljajo zadnjo možnost za zdravljenje najtežjih bakterijskih okužb. V sekvenciranje bomo vključili vse izolate s potrjenimi karbapenemazami, zbrane v vseh sedmih diagnostičnih laboratorijih NLZOH. S tem bomo pridobili dragocene podatke, ki bodo pomagali pri boljšem razumevanju širjenja teh bakterij in učinkovitejšemu nadzoru v bolnišnicah in širšem zdravstvenem sistemu.

---

🎤 Simpozij – SLOSEQ: Od sekvenc do javnega zdravja

Datum dogodka: 30. maj 2024
Organizator: Nacionalni laboratorij za zdravje, okolje in hrano (NLZOH)
Lokacija: Nacionalni inštitut za javno zdravje (NIJZ), Ljubljana
Udeleženci: Več kot 50 strokovnjakov s področij javnega zdravja, mikrobiologije, klinične prakse, raziskovalnih inštitutov, univerz, industrije ter odločevalcev v zdravstvenem sektorju

Simpozij z naslovom »SLOSEQ – od sekvenc do javnega zdravja« je v organizaciji NLZOH, skupaj s partnerjema NIJZ in UL-IMI predstavil možnosti za posodobitev in krepitev sistema molekularne epidemiologije v Sloveniji.

Otvoritveni nagovor je podala dr. Melita Vujnović, predstavnica Svetovne zdravstvene organizacije (WHO) v Sloveniji, ki je poudarila pomen nadzora nalezljivih bolezni v kontekstu globalnih groženj in hitro razvijajočih se tehnologij.

🔍Teme simpozija so vključevale:

• nove pristope in tehnologije v medicinski mikrobiologiji (vključno s sekvenciranjem genomov),
• digitalna orodja in rešitve za epidemiološki nadzor,
• spremljanje genetskih različic virusov SARS-CoV-2,
• praktične izzive pri sekvenciranju bakterijskih izolatov, zlasti večkratno odpornih sevov,
• pomen bioinformatskih orodij, interpretacije rezultatov in prenosa v prakso.

V sedmih strokovnih predavanjih so sodelovali raziskovalci in razvijalci iz vseh ključnih partnerjev projekta SLOSEQ. Udeleženci so z zanimanjem sodelovali v razpravah, kjer so izpostavili potrebo po boljši dostopnosti sodobnih diagnostičnih metod, sistematičnem usposabljanju kadra ter večji vlogi podatkov pri oblikovanju odzivnih politik.

Glavna sporočila dogodka:

• Slovenija že ima kakovostno infrastrukturo za sekvenciranje bakterijskih in virusnih genomov.
• Projekt SLOSEQ dodatno prispeva k razvoju digitalnih orodij, bazo AMR izolatov, usklajenih protokolov in bioinformatskih rešitev.
• Ključni izzivi ostajajo: trajnostno financiranje, izobraževanje uporabnikov, vključevanje v klinično prakso ter krepitev sodelovanja med sektorji.

---

🖥️ Prototip aplikacije za sestavljanje genomov

Datum: 26. junij 2024
Avtorja: Tom Koritnik in Tea Janko

V sodelovanju med NLZOH in Institutom Jožef Stefan je bil razvit grafični uporabniški vmesnik (GUI), ki uporabnikom omogoča enostavno sestavljanje genomov iz Illumina in Nanopore podatkov. Aplikacija omogoča uvoz, obdelavo in vizualizacijo kvalitetnih parametrov sestave genomov v enem okolju. Namenjena je laboratorijem, ki nimajo lastnega kadra s področja bioinformatike.

---

📲 Testiranje digitalnega orodja za spremljanje SARS-CoV-2
Datum: 28. junij 2024
Avtor: Mario Fafangel

V sodelovanju z NLZOH in UL-IMI je NIJZ razvil digitalno orodje za spremljanje pojavnosti novih različic virusa SARS-CoV-2. Sistem vključuje opozorilne mehanizme ter podporo za analiziranje trendov, kar omogoča pravočasno prepoznavanje potencialno nevarnih različic virusa. V rešitev so vključeni podatki treh laboratorijev, kar omogoča celosten in ažuren vpogled v razvoj epidemiološke situacije v Sloveniji.

Orodje je bilo preizkušeno v predprodukcijskem okolju. Funkcionalnosti in uporabnost na terenu so ocenili nacionalni epidemiologi, ki so potrdili, da sistem pomembno prispeva k učinkovitejšemu odzivu na širjenje virusnih različic in hitrejšemu obveščanju pristojnih služb.

---

📰 Informativni projektni letak

Datum: 30. oktober 2024
Uredila: Maja Rupnik

🧪Vzpostavitev Nanopore sekvenciranja za spremljanje SARS-CoV-2 v Sloveniji

Datum: 28. oktober 2024
Avtor: Andrej Steyer

V okviru projekta smo uspešno uvedli metodo sekvenciranja Oxford Nanopore Technologies (ONT) za spremljanje različic virusa SARS-CoV-2. Obe inštituciji, NLZOH in UL-IMI, sta razvili metodi za pripravo vzorcev in analizo sekvenc in jo primerjali z obstoječimi metodami (Illumina). Primerjalna analiza je potrdila zanesljivost Nanopore tehnologije, ki prinaša večjo hitrost in fleksibilnost pri spremljanju virusnih sevov ter predstavlja pomemben korak v razvoju odpornega in odzivnega sistema za genomski nadzor porajajočih se patogenov.

---

🧾 Določitev pogojev in pravil za nacionalno bazo podatkov AMR

Datum: 31. marec 2025
Avtorici: Tjaša Žohar Čretnik in Daša Kavka

Vzpostavljen je bil načrt in prototip nacionalne mikrobiološke zbirke podatkov  za spremljanje AMR v Sloveniji. Zbirka podatkov vključuje podatke o izolatih, ki so potrebni za spremljanje trendov odpornosti in analize drugih lastnosti mikroorganizmov, ki so podlaga za učinkovito ukrepanje. Opredeljeni in ovrednoteni so bili koraki in aktivnosti, ki so potrebni, da se vzpostavi ustrezna informacijska infrastruktura za nacionalno mikrobiološko zbirko podatkov.  

---

📚 Določitev pogojev in pravil delovanja za NCC-AMR

Datum: 30. maj 2025
Avtorici: Tjaša Žohar Čretnik in Daša Kavka

V okviru WP5 je bil pripravljen poslovnik o delovanju  Koordinacijskega centra za spremljanje odpornosti mikroorganizmov proti protimikrobnim zdravilom (KCAMR). Predvidena je vzpostavitev štiri-nivojskega sistema dostopa do podatkov, prilagojenega različnim uporabniškim potrebam, ki omogoča vključevanje bolnišnic, raziskovalnih ustanov in odločevalcev na nacionalni in lokalni ravni. Poslovnik opredeljuje tudi pravne podlage in tehnične zahteve za vzpostavitev centralizirane nacionalne mikrobiološke zbirke podatkov, ki bo služila kot temelj za učinkovito spremljanje in ukrepanje na področju AMR.

---

🧬 Pilotni projekt in zbirka več kot 900 bakterijskih izolatov za javnozdravstveno spremljanje

Datum: 19. junij 2025
Avtorica: Sandra Janežič

Pilotni projekt: rutinsko sekvenciranje in genomska analiza bakterij odpornih proti karbapenemom. Med januarjem 2024 in marcem 2025 smo sekvencirali in analizirali 954 bakterijskih izolatov. S tem projektom smo dobili podatke o njihovi genetski raznolikosti  in o tem kako ti izolati širijo po Sloveniji.

Sekvenciranje in analize so bile izvedene skladno s standardiziranim protokolom, sekvenčni podatki (genomi) pa oddani v javno dostopen arhiv NCBI (BioProject PRJNA1225923). Ta zbirka genomov predstavlja pomemben vir za razvoj in validacijo nacionalne baze podatkov o protimikrobni odpornosti (AMR) ter nudi dragocene informacije bolnišnicam pri obvladovanju širjenja večkratno odpornih bakterij.

---

📩 Sistem samodejnega obveščanja epidemioloških enot

Datum: 24. junij 2025
Avtorji: M. Fafangel, J. Rožanec, N. Kranjec, N. Kunšič

Vzpostavljen je sistem obveščanja o pomembnih različicah SARS-CoV-2 za regijske epidemiološke enote NIJZ. Obvestila se generirajo samodejno na podlagi analiz podatkov WGS. Sistem omogoča hitrejše in bolj usmerjeno odzivanje.

---

📦 Bioinformatski cevovod Singularity

Datum: 30. junij 2025
Avtorja: Tom Koritnik in Tea Janko

Izdali smo verzijo bioinformatskega cevovoda, pripravljenega v kontejnerskem okolju Singularity, in je prosto dostopen na: https://github.com/TKNLZOH.

Orodje je namenjeno naprednim uporabnikom, ki obvladajo delo v okolju ukazne vrstice Unix in poznajo orodja, vključena v cevovod. Kontejnerizacija omogoča ponovljivo in prenosljivo izvajanje analiz genomov, kar izboljšuje uporabnost v različnih računalniških okoljih.

---

💻 Javna izdaja GUI aplikacije in podporna dokumentacija

Datum: 30. junij 2025
Avtorja: Tom Koritnik in Tea Janko

Programsko opremo za analizo genomov, ki sta jo razvila NLZOH in Inštitut Jožef Stefan, smo uradno objavili in brezplačno omogočili za uporabo na spletu. Aplikacija omogoča uporabniku prijazen grafični vmesnik za sestavljanje genomov na podlagi podatkov sekvenciranja z metodama Illumina in Nanopore, pri čemer podpira standardizirane delovne tokove za ponovljivo genomsko analizo.

Za dostop do platforme je potrebna predhodna registracija, ki jo lahko uporabniki zahtevajo preko elektronske pošte na naslovu: support.gaapp@nlzoh.si. Po registraciji je programska oprema dostopna na naslovu: http://hgapp.nlzoh.si.

Celovit uporabniški priročnik je javno dostopen na povezavi: https://github.com/TKNLZOH in uporabnikom pomaga pri uporabi osnovnih funkcionalnosti platforme. Izdaja predstavlja pomemben mejnik pri razvoju dostopnih in kakovostnih orodij za analizo genomov v podporo javnemu zdravju in raziskovalnim dejavnostim.

---

Znanstvene objave

Wolde D, et al., Diarrheagenic Escherichia coli in Stool Specimens Collected from Patients Attending Primary Healthcare Facilities in Ethiopia: Whole-Genome Sequencing-Based Molecular Characterization, Journal: Int J Mol Sci. 2024; 25(19):10251 DOI: 10.3390/ijms251910251

Contribution: Provided genomic surveillance methodologies developed in SLOSEQ for pathogen tracking in LMIC settings.

Zohar Cretnik T, Maric L, Rupnik M, Janezic S.Different sampling strategies for optimal detection of the overall genetic diversity of MRSA, Microbiology Spectrum, 2024; 12(7) DOI: 10.1128/spectrum.00140-24

This article compared sampling approaches for capturing MRSA diversity, directly informed by SLOSEQ sampling data.

Maric L, Janezic S, Wiuff Coia C, Roer L, Rupnik M., Limited clonality but widespread plasmid sharing of ESBL-producing E. coli between humans and the environment of Northeastern Slovenia, Current Research in Microbial Sciences, 2025; 9, 100408 DOI: 10.1016/j.crmicr.2025.100408

Findings highlight interconnection of environmental and clinical resistomes, with direct relevance to the SLOSEQ project aims.

Predstavitve na kongresih

ESCMID Global 2024, Barcelona, Spain, poster presentation
Title: Genomic surveillance of multidrug-resistant bacteria – first results of the SLOSEQ project
Authors: Janežič S, Žohar Čretnik T, Golle A, Kramar U, Rupnik M, Ribič H
This poster summarized early outcomes of the SLOSEQ project, focusing on methodology development and data integration for real-time genomic surveillance of antibiotic-resistant bacteria in Slovenia.

9th Congress of the Slovenian Microbiological Society (2024), Maribor, Slovenia, poster presentation

Title: Konsolidacija in integracija genomskih analiz za rutinsko spremljanje večkratno odpornih bakterij v Sloveniji – prvi rezultati projekta SLOSEQ
Authors: Janežič S, Golle A, Kramar U, Rupnik M, Ribič H
The poster showcased the harmonization of genomic pipelines and their integration into national AMR monitoring systems.

9th Congress of the Slovenian Microbiological Society (2024), Maribor, Slovenia, invited lecture
Title: Pomen sekvenciranja celotnega genoma za spremljanje in obvladovanje širjenja hipervirulentnih sevov Klebsiella pneumoniae v regionalni bolnišnici (in Slovenian only)
Authors: Žohar Čretnik T, Selič Kurinčič T, Petrovč-Košćak A, Janežič S
The lecture presented a case study from a regional hospital, illustrating the utility of WGS in identifying and tracking high-risk K. pneumoniae clones.

Baničevi dnevi 2023, Maribor, Slovenia, invited lecture

Title: Večkratno odporne bakterije v bolnišničnih odpadnih vodah = Multi-resistant bacteria in hospital wastewater
Authors: Golle A, Marič L, Knez L, Novak G, Janežič S
This presentation discussed SLOSEQ environmental sampling and surveillance of hospital effluents.

19th CFGBC Symposium (2024), Ljubljana, Slovenia, invited lecture
Title: Molecular epidemiology – application of next generation sequencing in medical microbiology
Author: Maja Rupnik

12th Likarjev Simpozij (2024), Ljubljana, Slovenia, invited lecture

Title: Genomsko sekvenciranje za rutinsko spremljanje VOB v Sloveniji – projekt SLOSEQ
Author: Sandra Janežič

Joint Symposium of Medical Microbiologists and Infectiologists (2025), Ljubljana, Slovenia, invited lecture

Title: Sekvenciranje bakterijskega genoma – spremljanje povzročiteljev in analiza izbruhov, vabilo
Authors: Janežič S, Žohar Čretnik T, Strašek Smrdel K, Celar Šturm A, Triglav T

---

---

Trajanje / Duration: 1.7.2023 – 30.6.2025

Vodilni partner: Nacionalni laboratorij za zdravje, okolje in hrano (NLZOH)

Partnerji:  Nacionalni inštitut za javno zdravje (NIJZ); Inštitut za mikrobiologijo in imunologijo pri Medicinski fakulteti Univerze v Ljubljani

Trije projektni partnerji tvorijo strateški nacionalni okvir za diagnostično mikrobiologijo ter mikrobiološki in epidemiološki nadzor. NLZOH in UL-IMI opravita približno 95 % diagnostičnih preiskav s področja medicinske mikrobiologije v Sloveniji in služita vsem javnim zdravstvenim ustanovam v Sloveniji, vključno z Univerzitetnim kliničnim centrom Ljubljana, Univerzitetnim kliničnim centrom Maribor, 26 regionalnim in specializiranimi bolnišnicami, 62 primarnim zdravstvenim centrom in večini zasebnih zdravstvenih delavcev. Nacionalni inštitut za javno zdravje (NIJZ) je osrednja slovenska ustanova za prakso, raziskave in izobraževanje na področju javnega zdravja. Osnovna naloga NIJZ je zagotavljanje raziskav in analiz na področju zdravja ljudi ter varovanje in povečevanje ravni zdravja prebivalstva z ozaveščanjem prebivalstva in izvajanjem drugih preventivnih ukrepov.

The Lead Partner: National Laboratory of Health, Environment and Food (NLZOH)

Partners:  National Institute of Public Health (NIJZ); The Institute of Microbiology and Immunology at the Faculty of Medicine, University of Ljubljana (UL-IMI)

Three project partners form the strategic national framework for diagnostic microbiology and microbiological and epidemiological surveillance. NLZOH and IMI UL perform about 95 % of diagnostic tests in the field of medical microbiology in Slovenia and serve all public healthcare institutions in Slovenia, including University Medical Centre Ljubljana, University Medical Centre Maribor, 26 regional and specialised hospitals, 62 primary healthcare centres, and most private healthcare practitioners. The National Institute of Public Health (NIJZ – AE) is the central Slovenian institution for public health practice, research, and education. The primary function of NIJZ is to provide research and analysis in the field of human health and protect and increase the population’s level of health by raising the population’s awareness and carrying out other preventive measures.

Financiranje / Financing: 

SLOSEQ je projekt Evropske unije, ki ga sofinancira Evropska izvajalska agencija za zdravje in digitalno tehnologijo – HaDEA.

SLOSEQ is a European Union project co-financed by European Health and Digital Executive Agency – HaDEA.

Natisni