Prisotnost določenega mikroorganizma v vzorcu lahko potrdimo z dokazom specifičnega odseka nukleinske kisline (NK) mikroorganizma. Zato uporabimo metodo pomnoževanja NK. Najbolj znani in splošno razširjeni metodi sta verižna reakcija s polimerazo (PCR) in PCR v realnem času. S PCR lahko v kratkem času sintetiziramo veliko število kopij želenega odseka NK iz minimalnega števila tarčnih molekul (teoretično tudi iz ene same). Zaradi te značilnosti je PCR izredno občutljiva diagnostična metoda.

Virusne okužbe dihal in atipične pljučnice

Spolno prenosljive okužbe

Okužbe prebavil

Meningitis in encefalitis

Okužbe očesa

DNK vseh bakterij

Ošpice, rdečke, mumps

Okužbe s herpes virusi

Okužba s parvovirusom

Nadzorne kužnine